Evira hyväksyy laboratoriot, jotka saavat analysoida virallisen valvonnan yhteydessä otettuja näytteitä. Kansallisia vertailulaboratorioita ovat Eviran, Tullin ja Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen laboratoriot. Evira pitää rekisteriä hyväksytyistä laboratorioista.
Laboratoriolle asetetut vaatimukset on ilmoitettu asetuksessa (EY) N:o 882/2004 art. 12, elintarvikelaissa 23/2006 § 37-40, alkutuotantoasetuksessa 134/2006 § 16 sekä laboratorioasetuksessa 1174/2006.
Tietyt, laboratorioasetuksen 17 §:ssä säädetyt omavalvontatutkimukset on tehtävä Eviran hyväksymässä omavalvontalaboratorioissa, viranomaislaboratorioksi hyväksytyssä laboratoriossa tai kansallisessa vertailulaboratoriossa. Evira pitää rekisteriä myös omavalvontalaboratorioista.
Viranomaisen ja elintarvikealan toimijan on huolehdittava siitä, että niillä on käytössään laboratorio, jossa näytteet analysoidaan.
Viranomainen tai viranomaisen pyynnöstä vaatimukset täyttävä ulkopuolinen asiantuntija ottaa näytteet virallista valvontaa varten. Näytteen on edustettava tutkittavaa erää. Osanäytteiden määrä ja koko riippuvat mm. erän suuruudesta, aineen jakautumisesta erässä ja tutkittavan aineen partikkeli- ja pakkauskoosta. Näytteen tulee olla jäljitettävissä ja se on suojattava ulkoisilta vaikutuksilta ennen tutkimista.
Näytteenotosta säädetään valvonta-asetuksen 882/2004 art. 11 ja elintarvikelain 23/2006 § 50 ja maa- ja metsätalousministeriön asetuksessa 3/EEO/2000, jota sovelletaan myös omavalvonnassa. Lisäksi on useita aihekohtaisia säädöksiä muun muassa vierasaineiden näytteenottoon.