Maa- ja metsätalousministeriössä on viisi osastoa ja viisi osastojaon ulkopuolista yksikköä.
Osastot
Yleinen osasto
Maatalousosasto
Metsäosasto
Kala- ja riistaosasto
Elintarvike- ja terveysosasto
Erillisyksiköt
Henkilöstö- ja hallintoyksikkö
Talousyksikkö
Tietohallintoyksikkö
Viestintäyksikkö
sekä
Sisäinen tarkastus